64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3844 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 162 aa  317  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  51.59 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  50.76 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  51.61 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  45.22 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  47.18 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  46.77 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  49.65 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  44.65 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  41.14 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  42.14 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  41.1 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  41.22 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  42.11 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  45.39 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  40.99 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  41.14 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  38.71 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  35.9 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  43.57 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  34.42 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  40.16 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  34.42 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  38.66 
 
 		 174 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  34.97 
 
 		 190 aa  84.3  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  37.69 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  45.53 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.46 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  37.82 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  36.17 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  38.69 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  43.31 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  36.36 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  37.41 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  45.16 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.59 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  35.11 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  35.11 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  32.03 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  32.03 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  32.03 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  31.51 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  26.67 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  25.64 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  34.75 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.58 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  26.87 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  31.11 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  28.86 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.3 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  31.03 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  31.69 
 
 		 168 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 177 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  26.28 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  33.77 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  22.9 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  32.16 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>