47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2548 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  54.48 
 
 		 160 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  57.6 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  43.17 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  40.94 
 
 		 155 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  38.57 
 
 		 167 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  42.74 
 
 		 154 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  39.57 
 
 		 165 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  42.38 
 
 		 162 aa  85.9  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  38.03 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  42.54 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  42.52 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  42.74 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  39.49 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  36.02 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  36.89 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  36.15 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  39.84 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  36.03 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  36.03 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  34.27 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  36.15 
 
 		 157 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  38.06 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  35.56 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  35.76 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  35.85 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  34.38 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  34.96 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  35.04 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  27.86 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  31.58 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  23.13 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  27.08 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  43.86 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  32.5 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  30.23 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  25.55 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  32.56 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  31.78 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  31.34 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  32.5 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  34.78 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  30.43 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  25.76 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>