72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0627 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  73.39 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  73.02 
 
 		 190 aa  190  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  68.09 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  68.94 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  66.42 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  66.87 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  45.68 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  48.47 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  46.26 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  41.56 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  39.77 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  49.24 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  49.24 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  45.03 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  43.14 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  39.66 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  39.66 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  38 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  43.12 
 
 		 157 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  52.67 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  48.48 
 
 		 170 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  42.38 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  48.06 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  42.68 
 
 		 162 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  38.19 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  35 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  43.38 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  45 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  36.3 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  36.3 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  40.16 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  39.04 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  35.56 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  35 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  35.29 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  34.38 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  36.89 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  35.14 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  30 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.59 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  26.97 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  32.47 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  30.91 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  38.46 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.79 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.17 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  26.63 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.08 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  30.72 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  37.25 
 
 		 169 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.63 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  23.81 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  28.31 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  28.68 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  27.81 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  40.79 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  30.14 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  35.61 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  24.5 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  31.37 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  35.58 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  26.67 
 
 		 173 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  41.03 
 
 		 168 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  26.76 
 
 		 175 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  26.76 
 
 		 175 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  25.35 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  27.81 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  40.68 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  32.79 
 
 		 144 aa  41.2  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>