58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5956 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 167 aa  318  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  86.43 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  73.77 
 
 		 174 aa  168  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  68.75 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  59.88 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  74.59 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  47.24 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  50.31 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  53.16 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  51.3 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  44.38 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  47.97 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  49.37 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  50.36 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  46.43 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  51.56 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  48.2 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  40.88 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  48.51 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  39.1 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  40.88 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  49.21 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  42 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  42.65 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  40.14 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  42.48 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  36.99 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  38.64 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  36.11 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  36.11 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  41.45 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  43.57 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  36.55 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  39.84 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  40.17 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  40.4 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  28.39 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  38.46 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.43 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  29.45 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  39.32 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  28.37 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  35.04 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  46.38 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  28.67 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.59 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  29.27 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  30.2 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  29.94 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  28.83 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  28.05 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  27.78 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  28.4 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  27.1 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  28.57 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  31.94 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  22.86 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>