70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0909 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  83.21 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  83.94 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  53.74 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  52.21 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  46.5 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  45.81 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  40.94 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  40.94 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  40.54 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  41.94 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  42.64 
 
 		 182 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  41.09 
 
 		 188 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  40.32 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  40.77 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  37.91 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  41.94 
 
 		 217 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  39.23 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  36.5 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  38.17 
 
 		 176 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  35.53 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  30.97 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  34.97 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  37.06 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  35.44 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  34.78 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  30.09 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  38.69 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  37.78 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  38.69 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.68 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  36.99 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  32.87 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  32.87 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  35.56 
 
 		 171 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  35.77 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  25.6 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  34.23 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  36.97 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  35.83 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  36.97 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  35.83 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  23.97 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  32.12 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  31.01 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.14 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  33.11 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  33.11 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  30.22 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  34.68 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  33.1 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  30.72 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  35.29 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  32.99 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  27.14 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  26.54 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.79 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  28 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  28.77 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  28.46 
 
 		 172 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.76 
 
 		 172 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  30 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  29.79 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  28.4 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  29.58 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  29.58 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  31.88 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  29.58 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  29.58 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>