107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09724 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  100 
 
 
165 aa  323  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  41.33 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  48.41 
 
 
163 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  42.75 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  42.75 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  44 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  42.34 
 
 
169 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  37.58 
 
 
166 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  41.22 
 
 
163 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  45.97 
 
 
164 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  47.2 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  44 
 
 
168 aa  97.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  39.44 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  40.29 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  32.1 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  34.15 
 
 
163 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  37.82 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  39.31 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  37.01 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  36.92 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  39.53 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  34.65 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  33.86 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  39.01 
 
 
166 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  37.42 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  35.97 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  34.31 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  38.58 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  32.85 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  35.21 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  28.83 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  38.46 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  33.07 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  33.59 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  37.3 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  34.85 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  33.85 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  31.88 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  29.45 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  33.79 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  32.65 
 
 
168 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  32.21 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  30.61 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  34.56 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  29.41 
 
 
1210 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  34.78 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  32.54 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  30.2 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  31.71 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  30.37 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  32.81 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  32.56 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  30.15 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  30.47 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  27.66 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  28.06 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  26.52 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  26.95 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  28.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  26.95 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  30.16 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  26.81 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0073  disulphide bond formation protein DsbB  25.55 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  25.17 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  29.3 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
172 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  36 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.82 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  29.93 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  28.87 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  26.8 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  28.87 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>