48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3197 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  43.57 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  37.21 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  38.19 
 
 		 172 aa  94.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  38.19 
 
 		 172 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  40.27 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  38.93 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  39.47 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  32.48 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  37.58 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  43.75 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  38.56 
 
 		 179 aa  84.7  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  39.73 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  42.06 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  37.41 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  40.88 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  39.42 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  42.06 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  33.83 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  35.61 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  38.69 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  36.88 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  36.62 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  39.68 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.43 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  43.97 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  40.68 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  36.23 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  39.23 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  38.82 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  31.13 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  37.3 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.89 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  32.03 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  32.03 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  36.29 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  28.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  30.95 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  36.29 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  24.85 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  31.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  31.21 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  26.12 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  31.54 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>