73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1478 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 155 aa  294  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  62.91 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  56.14 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  52.21 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  48.45 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  48.45 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  57.89 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  47.44 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  46.62 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  39.13 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  40.88 
 
 		 217 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  42.66 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  40.69 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  41.01 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  38.81 
 
 		 188 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  38.36 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  42.86 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  37.34 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  37.74 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  39.01 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  39.37 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  37.69 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  38.36 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  35.11 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  37.34 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  36.88 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  29.87 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  35.34 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  36.71 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  39.13 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  34.29 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  32.84 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  32.84 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  27.12 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  36.13 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.81 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  32.32 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  31.25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  37.19 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  33.9 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  33.91 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  33.91 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  24.8 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  33.93 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.36 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  24.11 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  34.07 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  34.07 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  34.85 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  26.51 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  31.61 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  30.97 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  32.19 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  30.97 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.75 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.41 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  31.17 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  30.22 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  30.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  27.27 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  34.31 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  27.16 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  31.72 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  31.03 
 
 		 169 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.14 
 
 		 169 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  24.66 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  26.71 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  29.53 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 206 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>