132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0284 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 163 aa  321  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  63.19 
 
 		 163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  65.03 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  67.9 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  44.72 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  45.28 
 
 		 169 aa  152  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  49.37 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  44.44 
 
 		 183 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  46.76 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  38.93 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  45.57 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  45.24 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  37.84 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  41.98 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  38.32 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  39.74 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  40.82 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  40.97 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  46.36 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  41.22 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  41.36 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  39.57 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  39.57 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  39.13 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  40.14 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  36.69 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  40.97 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  35.9 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  37.24 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  38.62 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  39.16 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  38.89 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  37.41 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  31.16 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  33.08 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  32.08 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  32.62 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  30.43 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  30.61 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  29.79 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  32.7 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  30.99 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  31.33 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.56 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  29.22 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  32.61 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  29.37 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  29.03 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  29.71 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  30.46 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  31.47 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  28.15 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  31.03 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0073  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  29.08 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  29.08 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  29.08 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  28.68 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  32.79 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  32.58 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  32.58 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  31.82 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  32.58 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  28.15 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  31.3 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  29.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  28.24 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  27.92 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  27.34 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.06 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  29.32 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  26.09 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  29.6 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  32.28 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  29.29 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  29.29 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  29.6 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  28.06 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  29.6 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  26.09 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  27.1 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  28.12 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  23.84 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  27.05 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>