85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2859 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
162 aa  309  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0073  disulphide bond formation protein DsbB  42.33 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  36.62 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  39.72 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.93 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  36.84 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  34.51 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  33.57 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  31.16 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  38.03 
 
 
169 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  29.07 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  35 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  31.65 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  36.43 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  32.06 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  31.72 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  37.21 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  31.03 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  26.71 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  29.45 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  32.21 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  28.67 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.38 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  27.56 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  34.17 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.65 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  32.33 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  32.21 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  36.51 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  34.62 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  34.78 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  33.88 
 
 
1210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  34.4 
 
 
161 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  35.16 
 
 
170 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  29.48 
 
 
171 aa  52  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  35.16 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  35.16 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  35.16 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  34.46 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  32.79 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  31.82 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  31.97 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  28.28 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  33.59 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  33.59 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  29.46 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  31.41 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  27.59 
 
 
176 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  29.08 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  28.57 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  27.03 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  32.48 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  25.19 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  29.32 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  32.56 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  31.69 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  30.99 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  32.48 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  32.56 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  31.78 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  31.78 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  31.21 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  31.85 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  33.8 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  31.85 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  27.46 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  29.66 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  29.66 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  28.57 
 
 
174 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  29.66 
 
 
213 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  26.32 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  28.97 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  32.06 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  32.06 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  32.82 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>