132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3059 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  100 
 
 		 164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  57.14 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  51.59 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  48.97 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  42.77 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  45.96 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  49.67 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  46.54 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  45.57 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  42.31 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  41.83 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  44 
 
 		 176 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  45.22 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  43.33 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  42.96 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  42.25 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  45.95 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  40.91 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  45.65 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  46.51 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  39.74 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  40.24 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  38.41 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  37.88 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  31.65 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  38.03 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  38.51 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  38.46 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  38.06 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  37.69 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  37.23 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  36.5 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  34.12 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  38.81 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  30.92 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  35.77 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  36.05 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  32.87 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  29.53 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  34.01 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  32.86 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  34.4 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  27.81 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  32.58 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  34.03 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  32.65 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  33.6 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  33.59 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  32.73 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.14 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  32.84 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  32.09 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  33.57 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  32.26 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  30.6 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  32.12 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  34.92 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  31.51 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  31.51 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  33.1 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  32.59 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  33.09 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  32.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  32.84 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  30.07 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  35.07 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  32.41 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  32.41 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  32.41 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  32.41 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  30.37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  30.37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  34.56 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  34.03 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  34.03 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  31.72 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  34.03 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  28.86 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  33.57 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  32.84 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>