69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0260 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 168 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  72.46 
 
 		 168 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  72.46 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  73.65 
 
 		 168 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  40.56 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  35.71 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  34.97 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  35.61 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  38.36 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  34.27 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  36.09 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  33.76 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  36.59 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  34.93 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  32.48 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  29.49 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  31.65 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  30.97 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  31.45 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  32.45 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  29.63 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  37.31 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  36.3 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  31.34 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  28.95 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  32.39 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  29.85 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  28.48 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  31.76 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.21 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  31.69 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  31.69 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  32.19 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  31.13 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  27.33 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  30.82 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  32.59 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  31.34 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  25.53 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  25.56 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  29.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  28.47 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  31.74 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  28.23 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  30.41 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  27.11 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  28.92 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  29.05 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  27.45 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  27.86 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  29.23 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  31.06 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  27.03 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  28.24 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  28.19 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  28.79 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  27.54 
 
 		 175 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  26.67 
 
 		 168 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  26.67 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  26.67 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  28.29 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>