128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  69.94 
 
 
163 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  74.85 
 
 
163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  67.9 
 
 
163 aa  208  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  43.83 
 
 
166 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  47.53 
 
 
183 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  49.02 
 
 
172 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  47.47 
 
 
168 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  50 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  46.5 
 
 
168 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  40.25 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  42.48 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  43.14 
 
 
172 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  41.18 
 
 
168 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  37.82 
 
 
166 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  46.25 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  40 
 
 
176 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  41.98 
 
 
175 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  40 
 
 
176 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  46.51 
 
 
165 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  41.36 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  42.24 
 
 
167 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  43.17 
 
 
168 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 
174 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  34.03 
 
 
163 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  34.48 
 
 
163 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  37.76 
 
 
173 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  41.5 
 
 
177 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  37.82 
 
 
168 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  37.06 
 
 
173 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  39.13 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  38.73 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  37.67 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  39.38 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  41.25 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  37.76 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  38.41 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  37.68 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  37.27 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  34.38 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  35 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  35.92 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  39.86 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  35 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  36 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  32.73 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  33.94 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  34.81 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  34.81 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  31.37 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  29.88 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  32.24 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  35.62 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  30.87 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  30.87 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  29.63 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  28.93 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.53 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  33.83 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0073  disulphide bond formation protein DsbB  35.2 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  32.1 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  32.1 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 
175 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  32.68 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  35.95 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  32.68 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  29.63 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  32.68 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  31.29 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  31.29 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  34.27 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  32.62 
 
 
179 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  32.62 
 
 
179 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  32.35 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  31.03 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  30.22 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  28.83 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  33.81 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  28.75 
 
 
175 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>