134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0782 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  100 
 
 
168 aa  333  9e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  71.26 
 
 
172 aa  248  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  67.33 
 
 
173 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  66 
 
 
173 aa  210  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  49.04 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  41.82 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  43.24 
 
 
172 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  43.95 
 
 
168 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  38.61 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  43.28 
 
 
163 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  39.88 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  36.17 
 
 
168 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  44.08 
 
 
164 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  42.59 
 
 
168 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  42.04 
 
 
163 aa  104  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  35.03 
 
 
163 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  38.62 
 
 
176 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  37.28 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  37.93 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  34.67 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  37.25 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  35.53 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  35.53 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  37.59 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  36.36 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  37.12 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  34.16 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  34.35 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  32.92 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  32.92 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  32.84 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  29.75 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  35.07 
 
 
1210 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  37.25 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  35.57 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  34.76 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  28.37 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  33.77 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  33.11 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  37.06 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  33.57 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  31.58 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  34.29 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  31.76 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  36.3 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  32.86 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  32.86 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  33.8 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  32.68 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  28.83 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  35.14 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.16 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  35.53 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  34.17 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  33.56 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  32.65 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  32.95 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  34.39 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  35.53 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  35.53 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  35.53 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  28.83 
 
 
206 aa  57.4  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  36.55 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  34.92 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  33.57 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  36.07 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  36.64 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  34.87 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  32.67 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  37.25 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  28.05 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  31.71 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  34.88 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  34.88 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  36.15 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  34.96 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  38.26 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>