71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0215 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 168 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  85.71 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  86.31 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  73.65 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  38.46 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  34.97 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  38.1 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  41.26 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  36.3 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.9 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  37.74 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  29.77 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  29.33 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  33.12 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  37.2 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  32.03 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  34 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.46 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  35.34 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  31.01 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  33.79 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  33.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  33.62 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  29.56 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.69 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  36.57 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  33.57 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  32.86 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  34.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  28.47 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  32.65 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  34.35 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  32.61 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  32.61 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  27.81 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  30.88 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  29.17 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.66 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  24.43 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  30.64 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  28.29 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  31.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  26.74 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  27.85 
 
 		 213 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  27.85 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  27.85 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  22.63 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  27.63 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  28.85 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  24.42 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  28.77 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  32.79 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>