96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0132 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  100 
 
 		 175 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  75.43 
 
 		 175 aa  247  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  41.98 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  40.94 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  43.33 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  42.38 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  33.12 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  38.1 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  35.17 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.79 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  31.97 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  30.32 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  30.92 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0260  disulphide bond formation protein DsbB  36.59 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  33.78 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  32.9 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  29.73 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  33.8 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  30.07 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  31.54 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  24.43 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0190  disulphide bond formation protein DsbB  34.25 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  31.34 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0212  disulphide bond formation protein DsbB  33.56 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0215  disulphide bond formation protein DsbB  34.69 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  29.86 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  27.38 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  27.92 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  30.15 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  28.76 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.87 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  30.15 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  31.37 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  28 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  26.53 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  28.46 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  28 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  26.09 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  27.45 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  25.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  30.77 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  26.49 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  30.82 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  30.56 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  27.97 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  29.3 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  30.32 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  26.39 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  28.38 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  27.54 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  26.62 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  27.7 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  31.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  25.56 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  26.67 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  28.66 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  36.78 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  31.21 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  29.68 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  28.1 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  29.05 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  28.67 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  24.06 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  26.12 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  29.85 
 
 		 176 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  27.27 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  28.38 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  31.2 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  28.38 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  28.38 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  28.48 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>