100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0483 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  78.01 
 
 		 159 aa  234  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  42.31 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  43.31 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  42.75 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  40.38 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  41.67 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  38.1 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  36.11 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  36.69 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  36.69 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  38.4 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  35.44 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  31.45 
 
 		 1210 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  34.81 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  34.18 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  34.18 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  34.9 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  40 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  33.54 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.58 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  31.45 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  32.92 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.72 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  34.01 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  31.33 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  34.68 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  34.68 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  34.68 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  34.57 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  33.87 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  33.87 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  33.87 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  33.87 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  34.78 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  34.71 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  36 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  32.24 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  34.85 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  29.41 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  33.56 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  32.92 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  30.15 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  29.45 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  32.41 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  30.15 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  30.06 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  33.08 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  29.56 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  27.11 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  29.63 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  29.77 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  27.82 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  31.55 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  30.22 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  28.69 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  30.56 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  32.33 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  27.95 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  33.75 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  29.5 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  27.92 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  29.03 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  28.12 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  28.67 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  24.7 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  29.48 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  30.28 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  24.16 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  24.16 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  23.49 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  30.41 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  24.16 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  24.16 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  35.65 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  23.26 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  27.87 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  34.81 
 
 		 163 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  28.81 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  24.6 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  25 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  29.22 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>