54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0542 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  66.3 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  65.19 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  61.59 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  71.43 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  71.65 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  68.5 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  51.09 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  46.78 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  43.62 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  39.38 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  42.75 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  39.88 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  38.55 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  45.31 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  44.53 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  41.61 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  39.61 
 
 		 162 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  40.46 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  38.16 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  36.5 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  45.76 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  47.2 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  47.06 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  47.46 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  38.1 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.32 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  38.1 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  36.24 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  41.27 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  44.54 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  40.46 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  30.72 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.58 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  31.47 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  34.35 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  38.24 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  37.19 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  28.12 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  26.24 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  33.08 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  32.33 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  32.35 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  30.13 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  29.55 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  32.12 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  28.57 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  32.86 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  32.08 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  30.57 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  29.73 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>