53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0499 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  73.48 
 
 		 181 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  65.19 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  63.77 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  66.03 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  66.2 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  65.38 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  48.7 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  46.05 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  45.64 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  38.82 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  37.08 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  42.33 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  39.62 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  37.8 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  37.8 
 
 		 172 aa  95.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  40.14 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  41.96 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  39.86 
 
 		 157 aa  90.9  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  39.87 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  39.47 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  35.57 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  38.26 
 
 		 162 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  33.55 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  42.52 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  43.09 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  46.03 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  41.94 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  45.16 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.8 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  33.83 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  42.28 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  38.51 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  32.84 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  36.91 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  34.88 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  34.88 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  38.52 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  36.36 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  29.45 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  29.73 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.26 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  32.19 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  37.18 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  30.15 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  28.29 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  22.54 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  29.41 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  25.19 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  30.33 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  31.4 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>