78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1167 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 157 aa  309  9e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  63.7 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  51.82 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  54.48 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  51.08 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  51.08 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  55.56 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  43.95 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  42.86 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  40.82 
 
 		 175 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  42.55 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  38.71 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  41.79 
 
 		 217 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  41.1 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  42.25 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  39.37 
 
 		 181 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  40.46 
 
 		 182 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  40.6 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  38.1 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  40.16 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  39.61 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  39.85 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  40.29 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  37.69 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  35.06 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  35.81 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  35.71 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  35.71 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  36.43 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  35.26 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  29.8 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  28.26 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  40.34 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  36.59 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  28.23 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  26.09 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  32.77 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  37.82 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  32.03 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  33.61 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  34.74 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  33.09 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  33.09 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  29.63 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  29.63 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.47 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  28.89 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  32.32 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  29.79 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  30.19 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  30.5 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  32.23 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.72 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 178 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  33.11 
 
 		 172 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  28.37 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  29.01 
 
 		 176 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  29.38 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  25.69 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  33.07 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  28.38 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>