58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5213 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 178 aa  333  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  85.23 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  72.95 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  72.36 
 
 		 171 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  72.13 
 
 		 170 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  57.89 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  51.55 
 
 		 167 aa  134  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  51.9 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  51.3 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  46.88 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  48.65 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  51.27 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  46.67 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  48.63 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  42.76 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  45.99 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  49.25 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  41.78 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  41.78 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  51.15 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  46.56 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  47.41 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  40.25 
 
 		 157 aa  95.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  39.35 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  40.91 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  36.25 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  35.44 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  40.12 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  45.7 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  40.52 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  40.28 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  36.15 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  36.15 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  41.88 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  40.82 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  38.13 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  39.39 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  41.03 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  35.42 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  26.45 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  28.68 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.93 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  32.1 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  31.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  44.93 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  28.57 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  29.49 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  28.95 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  30.49 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  29.49 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  29.48 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  28.4 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  31.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  28.99 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  29.25 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5483  disulphide bond formation protein DsbB  26.55 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  45.24 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>