78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0726 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  87.93 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  90.64 
 
 		 171 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  61.18 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  73.55 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  72.27 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  51.12 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  47.06 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  48.25 
 
 		 170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  44.12 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  48.92 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  43.33 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  47.74 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  44.12 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  44.12 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  48.32 
 
 		 188 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  51.26 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  48.03 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  45.52 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  45.86 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  38.12 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  46.92 
 
 		 181 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  45.24 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  35.85 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  42.22 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  37.4 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  37.4 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  34.57 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  40.91 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  35.21 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  35.94 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  38.93 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  37.29 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.68 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25.95 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  33.09 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  29.07 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  37.29 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  27.61 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  30.72 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.97 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  30.72 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  30.72 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  25.83 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  39.51 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  23.4 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  27.04 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  27.67 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  27.74 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  28.4 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  26.71 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  26.8 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  29.08 
 
 		 176 aa  42  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 178 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  26.59 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  34.38 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  29.08 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  26.99 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 		 176 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.28 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  25.5 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  23.94 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  21.15 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  23.94 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  25.83 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>