86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1575 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 154 aa  293  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  98.7 
 
 		 154 aa  291  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  82.35 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  57.14 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  57.35 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  45.51 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  45.57 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  41.22 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  41.22 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  42.58 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  43.65 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  39.86 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  40.6 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  41.89 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  40.62 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  39.86 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  42.31 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  42.07 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  39.68 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  41.13 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  34.16 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  40.6 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  37.91 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  37.4 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  39.19 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  41.54 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  40.29 
 
 		 182 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  36.36 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  35.66 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  36.36 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  42.34 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  38.82 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  36.31 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  26.36 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  27.91 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  37.96 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  38.21 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  30.22 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  39.17 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  41.18 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  26.71 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  39.17 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  40.5 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  33.56 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  23.53 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  35.82 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  35.82 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  37 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  34.48 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  32.8 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  27.63 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  31.01 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  33.1 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.07 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  34.56 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  28.47 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  33.58 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  27.86 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  29.2 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  32.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  29.1 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  33.12 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  34.27 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  28.57 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  30.3 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  29.2 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  26.71 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  26.75 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  26.76 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  29.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  33.77 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.1 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  25.36 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  30.2 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  31.5 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2785  hypothetical protein  26.8 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  34.13 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  32.19 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  26.47 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  30.83 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>