33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0152 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  38.57 
 
 
161 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  35.71 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  30.26 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  40.28 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  32.33 
 
 
217 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  30.49 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  30.91 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  29.3 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  31.01 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  30.43 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  32.21 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  33.99 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  32.21 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  34.12 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  30.14 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  30.77 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  29.66 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  29.17 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  28.91 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  38.55 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  41.33 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  25.5 
 
 
174 aa  43.9  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  30.71 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  32.39 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  32.39 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  25.69 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  25.45 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  34.78 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  29.03 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  29.89 
 
 
188 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>