82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2493 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
157 aa  310  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  42.86 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  44.88 
 
 
170 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  44.88 
 
 
170 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  45.39 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  43.97 
 
 
155 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  45.71 
 
 
154 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  36.08 
 
 
164 aa  90.5  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 
176 aa  84  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  37.69 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  45.71 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  37.16 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  35.67 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  38 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  35.81 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  36.81 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  33.33 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.32 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  34.35 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  37.84 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  35.46 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  34.59 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  37.1 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  32.5 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  30.94 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  37.59 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  32.06 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  37.19 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  34.97 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  33.56 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  35.83 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  34.35 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.85 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  33.56 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  34.71 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  31.51 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  33.6 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  37.68 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  34.85 
 
 
201 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  35.77 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  25 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  40 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
179 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  25.66 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.18 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  28.87 
 
 
181 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  27.33 
 
 
166 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  27.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  26.49 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  28.22 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  29.22 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  28.68 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  51.22 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  29.29 
 
 
169 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  29.55 
 
 
175 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  26.95 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  25.53 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  25.93 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  25.93 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  30.5 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  24.82 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>