52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0047 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 162 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  68.29 
 
 		 171 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  66.39 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  65.57 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  62.81 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  52.31 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  61.34 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  47.59 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  51.09 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  44.65 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  46.43 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  45.1 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  41.83 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  46.9 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  46.72 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  45.38 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  38.22 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  38.22 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  38.51 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  46.56 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  46.46 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  43.55 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  43.28 
 
 		 174 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  40.85 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  36.96 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  36.76 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  37.19 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  37.19 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  36.69 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  33.6 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  36.42 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  40.34 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  36.43 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.88 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  40.48 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  28.86 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  39.2 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  39.68 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  28.03 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  30.37 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  41.18 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  37.9 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  32.56 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  40.58 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  32.39 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  32.43 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  34.06 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  30.07 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  40.54 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  36.49 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  28 
 
 		 175 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>