48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3497 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 177 aa  343  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  37.58 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  38.85 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  39.16 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  36.36 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  37.41 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  36.77 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  29.45 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  34.93 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  39.52 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  29.5 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  27.74 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  35.57 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  36.62 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.12 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  35.88 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  33.83 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  37.7 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  37.3 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  35.16 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  33.57 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  28.77 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  30.23 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  30.23 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  34.56 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  38.71 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  29.66 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  36.17 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  33.61 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  33.54 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  32.73 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  33.12 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  36.59 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  26.63 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  29.45 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  29.2 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  32.89 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.26 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  26.9 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  31.55 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  29.93 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  25.42 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  31.67 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>