57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3497 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  80.46 
 
 		 174 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  74.1 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  68.38 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  68.35 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  73.02 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  63.12 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  51.7 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  47.4 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  49.37 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  44.06 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  38.27 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  38.41 
 
 		 170 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  43.03 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  41.96 
 
 		 157 aa  97.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  39.51 
 
 		 171 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  39.13 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  47.69 
 
 		 174 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  38.35 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  38.35 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  38.85 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  48.06 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  39.74 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  50.39 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  46.88 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  52 
 
 		 167 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  40.79 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  36.23 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  42.48 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  43.2 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  41.79 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  39.01 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  37.12 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  34.67 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  33.09 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.85 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  37.4 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  38.52 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  27.91 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  30.07 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  29.56 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  26.06 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  31.93 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  27.46 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  24.83 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  35.03 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  27.4 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  33.08 
 
 		 1210 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  26.76 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  41.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  34.48 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.37 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  27.56 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>