49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0738 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  80.46 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  69.06 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  66.18 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  64.08 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  65.61 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  58.29 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  47.62 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  46.94 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  44.94 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  39.87 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  40.12 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  43.36 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  94.4  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  39.24 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  37.82 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  43.33 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  38.85 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  39.57 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  39.57 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  47.97 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  36.77 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  45.8 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  40.3 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  45.67 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  37.33 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  37.33 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  49.19 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  45.95 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  40.8 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  38.64 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  41.79 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  38.31 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  37.41 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  32.75 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  34.85 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  35.82 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  39.34 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  46.03 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  29.38 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  30.17 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.34 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  31.97 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  32.05 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.85 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  26.81 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  28.17 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  32.17 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>