124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2149 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  73.1 
 
 
178 aa  254  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  73.81 
 
 
178 aa  249  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  65.85 
 
 
173 aa  235  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  51.85 
 
 
177 aa  173  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  51.18 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  51.18 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  51.18 
 
 
213 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  52.14 
 
 
185 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  49.41 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  45.88 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  50 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  50.62 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  47.53 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  47.53 
 
 
175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  46.91 
 
 
175 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  45.03 
 
 
171 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  44.38 
 
 
169 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  48.5 
 
 
176 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  48.24 
 
 
178 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  45.68 
 
 
175 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  45.29 
 
 
178 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  45.29 
 
 
176 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  44.71 
 
 
176 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  47.09 
 
 
179 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  44.71 
 
 
176 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  46.51 
 
 
175 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  45.93 
 
 
179 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  45.35 
 
 
179 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  46.75 
 
 
176 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  43.2 
 
 
175 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  43.87 
 
 
188 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  47.65 
 
 
176 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  45.03 
 
 
169 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  38.6 
 
 
172 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  42.24 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  39.66 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  42.11 
 
 
171 aa  125  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  30.54 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  30.2 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  32.85 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  30.94 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  25.97 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  28.32 
 
 
212 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  32.65 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  28.74 
 
 
211 aa  60.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  27.93 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  29.14 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  30.99 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  30.47 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  28.8 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  28.87 
 
 
174 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  30.87 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  31.06 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  33.88 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  28.67 
 
 
168 aa  57.8  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  28.77 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  29.27 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  29.25 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  28.77 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  28.83 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.19 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  30.83 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  28.29 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  30.15 
 
 
264 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  32.85 
 
 
261 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  29.14 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  29.01 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  32.12 
 
 
261 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  29.41 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  26.67 
 
 
231 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  29.93 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  26.35 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  30.14 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  29.53 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  29.45 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  29.13 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  26.53 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  28.89 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  24.85 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  30.22 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  30 
 
 
165 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  28.99 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  28.57 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>