59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2556 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  100 
 
 		 175 aa  337  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2610  disulphide bond formation protein DsbB  41.1 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  31.21 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  33.12 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  33.12 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  31.14 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  33.74 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  30.18 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  29.34 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  34.64 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  30.82 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  30.68 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  30.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  29.92 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  30.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  32.14 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  27.39 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  35.06 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  32.28 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  31.58 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  30.36 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  31.16 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  34.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  32.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  26.21 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  31.88 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  27.17 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  30.28 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  28.28 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  28.39 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  43.75 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  25.83 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47560  disulfide bond formation protein  38 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  32.68 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  30.91 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  29.37 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  32.28 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  31.16 
 
 		 1210 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  28.03 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  28.3 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  50 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  28.57 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  26.8 
 
 		 176 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  31.93 
 
 		 179 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  29.37 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  31.93 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  27.03 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  27.03 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  31.09 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  25.45 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>