60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2610 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2610  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 165 aa  327  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  41.72 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  31.74 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  32.75 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  30.36 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  30.34 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  33.1 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  30.34 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  30.19 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  29.03 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  23.78 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  28.4 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  29.53 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  31.94 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  30.88 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  30.32 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  27.74 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  30.53 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  29.38 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  28.48 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  26.14 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  24.66 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0848  disulfide bond formation protein B  26.54 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  26.67 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2859  disulphide bond formation protein DsbB  26.67 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  27.08 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0468  disulphide bond formation protein DsbB  25.16 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0356503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  24.84 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  23.57 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  29.87 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0058  disulfide bond formation protein DsbB  30.2 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09724  disulfide bond formation protein  25 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0976  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2913  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2973  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0171  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2604  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0458  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  24.81 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  24.1 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0284  disulphide bond formation protein DsbB  31.08 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69400  disulfide bond formation protein  31.25 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  24.22 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  24.18 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2374  disulfide bond formation protein B  26.24 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0714  disulfide bond formation protein B  25.95 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4133  disulfide bond formation protein B  26.14 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  23.66 
 
 		 172 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0980  disulfide bond formation protein B  25.49 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0542  disulfide bond formation protein B  25.49 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1021  disulfide bond formation protein B  25.49 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  26.88 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0132  DsbB family protein  25.32 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0897  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0885  disulfide bond formation protein B  25 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1614  disulfide bond formation protein B  26.36 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  25.69 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0782  disulfide bond formation protein B  35.71 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.136765  normal  0.0551075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>