More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6691 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6691  peptide deformylase  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6172  peptide deformylase  80 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2092  peptide deformylase  60.26 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3949  peptide deformylase  58.93 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4424  peptide deformylase  63.29 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.377454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0628  peptide deformylase  54.66 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.50576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  53.09 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0521  peptide deformylase  51.85 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4317  peptide deformylase  58.33 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.063232  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  54.88 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2070  peptide deformylase  48.47 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3105  peptide deformylase  51.83 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1867  peptide deformylase  47.2 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0630073  normal  0.10208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2025  peptide deformylase  44.94 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.68 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.36 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  41.36 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.76 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  41.1 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  41.67 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  41.57 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  41.57 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  41.57 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  41.57 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.67 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.76 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.76 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  39.76 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.43 
 
 		 188 aa  130  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  41.46 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  41.46 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  40.12 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  39.76 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  40.96 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.18 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  39.16 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  40.96 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  39.76 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40.85 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.65 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  40.96 
 
 		 216 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.16 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  39.16 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  39.16 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  40.8 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.79 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.29 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  39.16 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  39.88 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  38.04 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  41.46 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  37.43 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  38.37 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  42.07 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  41.18 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  38.55 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  38.55 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  41.57 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.41 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  36.81 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  41.92 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.58 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  40.96 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  38.79 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  41.32 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  39.02 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  37.21 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  39.35 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  36.63 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  40.12 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  36.2 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  38.55 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  39.75 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  41.57 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  36.9 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  38.15 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  39.16 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  36.53 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  39.39 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  36.75 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  38.79 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  37.72 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  37.5 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  38.92 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  34.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0833  peptide deformylase  40.36 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  36.36 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  41.32 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  37.18 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>