More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3949 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3949  peptide deformylase  100 
 
 		 176 aa  347  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4317  peptide deformylase  98.86 
 
 		 176 aa  345  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.063232  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4424  peptide deformylase  88.64 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.377454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2092  peptide deformylase  63.1 
 
 		 165 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0628  peptide deformylase  57.4 
 
 		 168 aa  187  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.50576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6691  peptide deformylase  57.74 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  54.49 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0521  peptide deformylase  53.29 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  54.76 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3105  peptide deformylase  51.18 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2070  peptide deformylase  47.02 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6172  peptide deformylase  57.33 
 
 		 165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.79 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.77 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.77 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.43 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.47 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1867  peptide deformylase  44.58 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0630073  normal  0.10208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  40.46 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  43.1 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.31 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.59 
 
 		 171 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.9 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  46.33 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40.59 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  45.2 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  42.05 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  39.56 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.5 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  35.71 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  38.37 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  43.75 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  37.87 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.23 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  36.84 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  38.6 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  38.01 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  37.13 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  38.51 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  38.51 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2025  peptide deformylase  39.24 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.93 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  35.67 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.93 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.93 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.64 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.93 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.64 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  35.33 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  36.31 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  39.11 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  37.5 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  37.28 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  37.5 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.53 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  35.71 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  35.59 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  36.31 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  34.66 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  36.16 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  35.12 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  35.12 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  36.16 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  35.71 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  35.12 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  37.64 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  35.26 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  36.53 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  35.63 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  39.53 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  34.52 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  34.52 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  34.52 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  40.43 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  36.26 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  35.93 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  35.33 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  34.68 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  34.48 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  37.04 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.76 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.67 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  34.09 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  33.52 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  32.95 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.37 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  35.98 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>