More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3798 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3798  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1367  LysR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2018  LysR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132801  normal  0.140237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5852  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4556  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230121  normal  0.746697 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3484  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.5787  normal  0.103031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4035  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1183  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0831  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0434505  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0654  regulatory protein, LysR  38.7 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2334  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0321  transcriptional regulator LysR family  39.79 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.916325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5661  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0995  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1260  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00909  transcriptional regulator LysR family  41.44 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0474149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2888  transcriptional regulator, LysR family  40.5 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0176531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1379  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3403  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1440  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1792  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2689  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.876751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3867  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0459798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0005  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1946  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1861  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2422  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.8 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.727626  normal  0.292199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2017  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3458  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3124  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2444  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3707  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2804  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3529  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589302  normal  0.0874139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2094  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2991  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194845  normal  0.0299844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3443  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3250  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0610  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3633  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1110  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3182  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3850  transcriptional activator NhaR  28.47 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4158  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00631  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.45 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0783692  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2604  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.704513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0695  transcriptional activator NhaR  27.05 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000192027  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2067  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.016585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0292  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0581  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000122436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3656  transcriptional activator NhaR  27.4 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.231756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3637  transcriptional activator NhaR  26.03 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0575  transcriptional activator NhaR  27.53 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000414941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3860  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3085  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4462  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3133  transcriptional regulator, LysR family  26.71 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3577  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000233722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00019  DNA-binding transcriptional activator  25.68 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.537169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0020  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0020  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0536334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00020  hypothetical protein  25.68 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0017  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0018  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.278045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0018  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2321  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000823941  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4198  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3405  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2939  transcriptional activator NhaR  27.12 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3167  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000877646  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0584  transcriptional activator NhaR  24.57 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0870  transcriptional activator NhaR  27.4 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4489  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1718  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0045  transcriptional activator NhaR  26.41 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0045  transcriptional activator NhaR  26.41 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.87006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0043  transcriptional activator NhaR  26.41 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.73078  hitchhiker  0.00860797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0044  transcriptional activator NhaR  26.12 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0044  transcriptional activator NhaR  26.12 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  0.174595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3463  transcriptional activator NhaR  26.09 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0794  transcriptional activator NhaR  26.09 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000965689  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1027  transcriptional activator NhaR  28.46 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1044  transcriptional activator NhaR  26.71 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3591  transcriptional activator NhaR  26.09 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000348545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0209  transcriptional activator NhaR  29.11 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000105029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3265  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000583732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0545  transcriptional activator NhaR  26.76 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5521  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.0878172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0808  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.461181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1233  transcriptional activator NhaR  27.82 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.498359  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1138  transcriptional activator NhaR  27.11 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2776  transcriptional activator NhaR  27.17 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3122  transcriptional activator NhaR  25.68 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.896078  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1149  transcriptional activator NhaR  25.96 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.291866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1191  transcriptional activator NhaR  25.34 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1235  transcriptional activator NhaR  25.34 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1268  transcriptional activator NhaR  25.34 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3348  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1338  transcriptional activator NhaR  27.2 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2751  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>