84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0304 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  98.45 
 
 
193 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  88.89 
 
 
215 aa  381  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  78.79 
 
 
193 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  51.76 
 
 
183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  56.85 
 
 
194 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  55.17 
 
 
162 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  40.62 
 
 
148 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  40.77 
 
 
156 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  39.26 
 
 
164 aa  101  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  38.52 
 
 
152 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  43.08 
 
 
154 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.38 
 
 
334 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  29.71 
 
 
279 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  26.67 
 
 
408 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  22.84 
 
 
787 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  28.42 
 
 
421 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  22.58 
 
 
600 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  22.5 
 
 
789 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  23.23 
 
 
842 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.6 
 
 
275 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  25.39 
 
 
308 aa  51.6  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  27.22 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  28.42 
 
 
564 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  27.66 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  33.71 
 
 
260 aa  48.9  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  27.06 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  36.62 
 
 
287 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  26.85 
 
 
412 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  32.38 
 
 
272 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.2 
 
 
284 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  34.85 
 
 
487 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  22.56 
 
 
275 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  27.81 
 
 
501 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  25.57 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  25.15 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  25.68 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  27.52 
 
 
440 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  24.7 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  25.68 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  25.25 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  27.81 
 
 
507 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  30.48 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  28.15 
 
 
478 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  27.35 
 
 
275 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  25.77 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  26.4 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.46 
 
 
480 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28 
 
 
477 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28 
 
 
483 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  22.65 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  28 
 
 
483 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  28 
 
 
472 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  25.43 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  30.16 
 
 
296 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  25.2 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  25.93 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  26.01 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.13 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  25.71 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  25.32 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  23.14 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  22.1 
 
 
311 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  24.68 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  27.88 
 
 
264 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  24.86 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  22.1 
 
 
311 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  29.51 
 
 
287 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  29.23 
 
 
432 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  29.51 
 
 
285 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  26.81 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  24.75 
 
 
496 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  27.64 
 
 
298 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  24.41 
 
 
268 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  31.65 
 
 
261 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  22.22 
 
 
253 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
378 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  33.8 
 
 
176 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.11 
 
 
508 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
470 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>