191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0980 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  44.78 
 
 		 381 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  44.61 
 
 		 496 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  44.19 
 
 		 501 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  44.78 
 
 		 498 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  44.78 
 
 		 498 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  44.19 
 
 		 507 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  44.78 
 
 		 498 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  44.57 
 
 		 508 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  43.75 
 
 		 440 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  42.28 
 
 		 275 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  42.55 
 
 		 564 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  43.84 
 
 		 483 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  43.84 
 
 		 483 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  43.48 
 
 		 472 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  41.76 
 
 		 478 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  41.39 
 
 		 480 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  44.19 
 
 		 477 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  42.7 
 
 		 421 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  43.51 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  37.13 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  35.77 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  35.57 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  35.57 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  35.57 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  47.1 
 
 		 412 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  45.88 
 
 		 470 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  47.24 
 
 		 378 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  30.71 
 
 		 408 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  31.73 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  33.78 
 
 		 842 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  37.28 
 
 		 787 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  30.99 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  31.33 
 
 		 487 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  36.84 
 
 		 600 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  30.74 
 
 		 789 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  27.5 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  39.44 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  26.28 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  26.28 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  26.28 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.52 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  30.3 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.09 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  31.54 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  31.47 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  28.68 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  33.76 
 
 		 319 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  29.44 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  27.71 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  31.72 
 
 		 335 aa  86.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  28.14 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  38.26 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  32 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  35.48 
 
 		 629 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  28 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  36.09 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  33.08 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  28.25 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  30.21 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  27.82 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  26.34 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  31.29 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  25.19 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  27.71 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  24.61 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  24.61 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  27.88 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  24.8 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  27.71 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  32.05 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  27.71 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  32.69 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  30.13 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  33.09 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  27.06 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  26.41 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  25.93 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  30.71 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  33.14 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  26.83 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  23.14 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  28 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  28.66 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  25.49 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  25.49 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  25.71 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  27.41 
 
 		 527 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  27.14 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  28.66 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  25.22 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  24.32 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  25.68 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>