67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1404 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28.22 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  27.27 
 
 
787 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  29.68 
 
 
789 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  28.89 
 
 
842 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
600 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  30.46 
 
 
487 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  28.16 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  31.72 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  27.56 
 
 
408 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  29.87 
 
 
472 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  32.26 
 
 
483 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  32.26 
 
 
477 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  32.26 
 
 
483 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  27.54 
 
 
496 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  28.83 
 
 
508 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.06 
 
 
498 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  28.22 
 
 
498 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  28.22 
 
 
498 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  28.82 
 
 
507 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  28.82 
 
 
501 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  26.28 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  28.16 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  29.19 
 
 
564 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  45 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  26.09 
 
 
440 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  27.49 
 
 
378 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  27.7 
 
 
412 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  26.99 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  26.77 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  29.33 
 
 
470 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  28.19 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  25.67 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  43.33 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  29.52 
 
 
319 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  26.11 
 
 
480 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.11 
 
 
478 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  36 
 
 
450 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  44.68 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  24.5 
 
 
474 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  30.43 
 
 
304 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  29.13 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  25.27 
 
 
439 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  28.47 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  24.34 
 
 
279 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  25.16 
 
 
629 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  31.75 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  29.33 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  21.71 
 
 
504 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  34.48 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  24.22 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  29.17 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  29.5 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  44.23 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  30.22 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  30.22 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  29.17 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  30.16 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  29.17 
 
 
232 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  30.16 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  30.16 
 
 
193 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  37.1 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  30.16 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  29.55 
 
 
335 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  31.52 
 
 
176 aa  42.7  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3450  hypothetical protein  29.49 
 
 
375 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0757309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>