167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3452 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  39.24 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  37.89 
 
 		 629 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.99 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.25 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  26.69 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.62 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.74 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  30.29 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  32.42 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.44 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  29 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  25.45 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  24.34 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  25.55 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  34.06 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  32.56 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  32.56 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  32.56 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  27.65 
 
 		 600 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  34.01 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  26.74 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  32.56 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  33.08 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  32.31 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  32.31 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  32.31 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  32.31 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  37.76 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  32.03 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  30.25 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  25.48 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  31.82 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  30.6 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  29.38 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  32.14 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  28.02 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  26.36 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  33.04 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  25.97 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  35.71 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  35.71 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  31.5 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  33.59 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  35.94 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  35.94 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  35.94 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  23.11 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  24.71 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  31.67 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  27.61 
 
 		 842 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  28.86 
 
 		 787 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  25.63 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  29.23 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  25.29 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  30.58 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  31.96 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  25.76 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  26.71 
 
 		 487 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  29.86 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  25.76 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  25.76 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  32 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  32.26 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  25.38 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  24.9 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  40.79 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  27.07 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  26.56 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  29.13 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  28.32 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  32.56 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  28.85 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  25.85 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  32.32 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  29.9 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  29.9 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  27.34 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  25.37 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  28.32 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  28.32 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  26.84 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  25.19 
 
 		 552 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  31.4 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  25.6 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  27.84 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  36.94 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.14 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  32.61 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  22.95 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  30.23 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>