129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0704 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  94.4 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  77.61 
 
 		 265 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  67.29 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  50.76 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  50.2 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  46.47 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  44.24 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  44.7 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  44.15 
 
 		 432 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  43.38 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  40.48 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  41.48 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  42.6 
 
 		 298 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  42.22 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  41.03 
 
 		 419 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  40.81 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  41.92 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  44.08 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  42.11 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  44.81 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  42.91 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  41.57 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  43.08 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  41.5 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  41.5 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  40.15 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  41.39 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  40.98 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  40.98 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  43.23 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  41.73 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  39.62 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  39.18 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  39.39 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  38.43 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  38.74 
 
 		 253 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  43.48 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  38.76 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  36.72 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  38.52 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  36.98 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  42.7 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  39.78 
 
 		 270 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  37.84 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  39.06 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  38.11 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  36.8 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  36.72 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  36.72 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  35.94 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  36.78 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  34.4 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  32.83 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  45.58 
 
 		 371 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  33.47 
 
 		 552 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  35.29 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  33.05 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  28.15 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  30.93 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  27.69 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  26.92 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  30.2 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  32.12 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  29.28 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.68 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  36.05 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  36.05 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  27.49 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  27.6 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  35.37 
 
 		 508 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  36.05 
 
 		 498 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  36.05 
 
 		 498 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  36.05 
 
 		 498 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  34.69 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  36.67 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  27.21 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  34.01 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  33.55 
 
 		 472 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  33.55 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  33.55 
 
 		 483 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  33.55 
 
 		 440 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  35.94 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  30.22 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  32.67 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  32.67 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  32.05 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  31.97 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  34.65 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.63 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  31.21 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.68 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0855  protein of unknown function DUF88  40.19 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0449  hypothetical protein  31.09 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.924551  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  32.03 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>