219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0007 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  980    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  35.25 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  34.98 
 
 		 600 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  33.75 
 
 		 787 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  34.58 
 
 		 842 aa  153  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  36.75 
 
 		 789 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  31.33 
 
 		 260 aa  116  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  29.06 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.07 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  27.8 
 
 		 564 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.15 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.39 
 
 		 253 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  28.4 
 
 		 507 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  28.29 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  27.92 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  26.67 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28.03 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28.98 
 
 		 253 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  27.8 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  27.8 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  28.98 
 
 		 253 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28.02 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.87 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  28.47 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  27.8 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  27.69 
 
 		 496 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  27.9 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  28.88 
 
 		 478 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  34.12 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  27.93 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  26.16 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  26.16 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  26.43 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  31.48 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  26.69 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  25.33 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  25.33 
 
 		 234 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  27.04 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  26.84 
 
 		 236 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.94 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  32.78 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  27.97 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  26.55 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  25.56 
 
 		 275 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  24.12 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  33.14 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  25.42 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  30.36 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  26.49 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  27.07 
 
 		 239 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  31.41 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  29.88 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  27.37 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  25.51 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  26.02 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25.99 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  26.61 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  32.24 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  28.41 
 
 		 195 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  29.3 
 
 		 158 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  26.71 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  25.61 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  21.74 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  28.98 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  25.16 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  31.61 
 
 		 193 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  32.26 
 
 		 165 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  31.17 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  33.88 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  24.47 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  30.46 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  26.02 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  30.13 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  24.07 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  30.9 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  30.82 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  28.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  31.17 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  22.89 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  30.38 
 
 		 158 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  30.11 
 
 		 195 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  24.78 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  25.3 
 
 		 262 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  29.59 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  23.14 
 
 		 263 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  22.49 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  28.72 
 
 		 192 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  22.49 
 
 		 232 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  30.12 
 
 		 207 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  28.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  38.27 
 
 		 194 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  28.22 
 
 		 213 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>