194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1072 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  73.41 
 
 		 508 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  75.26 
 
 		 498 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  96.84 
 
 		 501 aa  875    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1018    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  75.42 
 
 		 498 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  75.42 
 
 		 498 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  74.18 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  82.97 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  80.88 
 
 		 564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  81.82 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  51.65 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  69.3 
 
 		 478 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  78.09 
 
 		 381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  68.86 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  64.34 
 
 		 275 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  53.16 
 
 		 308 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  59.39 
 
 		 264 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  44.19 
 
 		 260 aa  219  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  41.37 
 
 		 253 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  40.96 
 
 		 253 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  40.96 
 
 		 253 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  39.85 
 
 		 249 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  35.86 
 
 		 378 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  46.98 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  49.66 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  36.47 
 
 		 842 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  36.63 
 
 		 787 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  28.78 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  31.92 
 
 		 789 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  28.83 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  28.21 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  32.32 
 
 		 268 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  30.95 
 
 		 259 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  30.59 
 
 		 299 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.11 
 
 		 329 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  30.34 
 
 		 258 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  32.35 
 
 		 272 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  27.42 
 
 		 258 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  30.77 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  27.82 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  36.08 
 
 		 286 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  29.84 
 
 		 264 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  29.84 
 
 		 275 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  33.55 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  31.71 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  28.95 
 
 		 234 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  28.35 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  28.95 
 
 		 234 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  29.07 
 
 		 272 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  29.06 
 
 		 284 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  29.41 
 
 		 319 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  31.71 
 
 		 448 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  26.85 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  29.03 
 
 		 246 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  30.28 
 
 		 259 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  36.13 
 
 		 232 aa  87  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  30.28 
 
 		 335 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  36.13 
 
 		 232 aa  86.7  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  32.85 
 
 		 240 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  36.13 
 
 		 232 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  27.92 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  35.1 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  31.63 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  31.42 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  36.05 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  36.49 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  23.53 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  25.91 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  35.37 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  29.41 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  30.38 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  29.22 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  28.06 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  31.1 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  28.74 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  28.48 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  32.64 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  31.33 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  28.97 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  27.92 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  35.9 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  28.63 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  26.88 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  35.2 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  32.47 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  27.39 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  30.61 
 
 		 418 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  27.39 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  29.68 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  29.69 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  29.27 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  43.12 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>