171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3179 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  76.36 
 
 
165 aa  260  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  73.33 
 
 
165 aa  254  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  72.73 
 
 
165 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  70.91 
 
 
165 aa  243  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  39.33 
 
 
157 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  35.62 
 
 
170 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  36.97 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  38.36 
 
 
192 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  37.42 
 
 
184 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  37.25 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  37.33 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  39.26 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  37.09 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  111  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  39.31 
 
 
158 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  37.33 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  34.9 
 
 
157 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  36.54 
 
 
167 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  36.42 
 
 
167 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  33.12 
 
 
184 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  37.67 
 
 
158 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  36.73 
 
 
159 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  36.73 
 
 
158 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  36.73 
 
 
159 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  36.73 
 
 
159 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  34.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  34.21 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  34.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  36.05 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  35.62 
 
 
159 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  36.05 
 
 
158 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  32.67 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  36.05 
 
 
159 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1261  hypothetical protein  30.92 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0151498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  35.76 
 
 
158 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  36.14 
 
 
189 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  35.92 
 
 
156 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  35.17 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  31.85 
 
 
228 aa  87.8  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  34 
 
 
201 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  30 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  32.21 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  80.9  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  32.35 
 
 
214 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  32 
 
 
226 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  32 
 
 
226 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  31.33 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  32.73 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  31.9 
 
 
213 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  32.52 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  32.52 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  30.81 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  29.38 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  29.38 
 
 
178 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  29.22 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  27.95 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  31.9 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  33.13 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  33.53 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  28.66 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  34.16 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  33.13 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  32.93 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  31.85 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  39.62 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  33.13 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  33.13 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  32.93 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  33.54 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  30.95 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  33.54 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  33.54 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  29.81 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  27.44 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  30.92 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.93 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  31.29 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  28.03 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  29.56 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  31.33 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  27.78 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  25 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  29.19 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  31.41 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  30.06 
 
 
193 aa  61.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  28.25 
 
 
203 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  28.66 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  30.25 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>