150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0944 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  82.61 
 
 
191 aa  324  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  81.08 
 
 
192 aa  323  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  82.07 
 
 
191 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  83.06 
 
 
193 aa  317  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  80.32 
 
 
193 aa  315  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  81.32 
 
 
195 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  73.18 
 
 
218 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  73.18 
 
 
218 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  73.45 
 
 
217 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  73.3 
 
 
213 aa  279  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  72.53 
 
 
216 aa  277  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  69.78 
 
 
217 aa  275  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  71.04 
 
 
219 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  68.68 
 
 
208 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  70.33 
 
 
205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  70.52 
 
 
228 aa  271  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  69.78 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  70.45 
 
 
202 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  68.93 
 
 
205 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  69.54 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  69.77 
 
 
216 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  66.67 
 
 
206 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  69.94 
 
 
203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  63.3 
 
 
214 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  65.36 
 
 
189 aa  251  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  65.38 
 
 
190 aa  250  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  65.38 
 
 
190 aa  250  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  64.84 
 
 
190 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  62.71 
 
 
207 aa  248  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  63.84 
 
 
183 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  65.12 
 
 
190 aa  241  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  64.53 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  61.17 
 
 
190 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  51 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  56.76 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  54.86 
 
 
179 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  40.11 
 
 
194 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  37.1 
 
 
198 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  33.88 
 
 
210 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  33.88 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  33.87 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  35.43 
 
 
173 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  33.53 
 
 
201 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  34.91 
 
 
180 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  37.85 
 
 
186 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  34.68 
 
 
178 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  34.68 
 
 
178 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  34.52 
 
 
171 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  35.2 
 
 
304 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  34.71 
 
 
173 aa  98.2  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  34.71 
 
 
228 aa  97.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  35.63 
 
 
168 aa  97.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  34.46 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  38.57 
 
 
287 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  37.59 
 
 
294 aa  96.3  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  35.84 
 
 
287 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  33.93 
 
 
172 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  37.58 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  29.38 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  31.9 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  31.76 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  32.93 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  30.46 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  32.53 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  31.9 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  29.82 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  30.57 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0526  hypothetical protein  30.86 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  27.89 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  33.72 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  30.72 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  29.81 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  29.81 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  31.9 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6284  hypothetical protein  64.44 
 
 
48 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217301  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  31.65 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  31.29 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  31.01 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  31.52 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  29.27 
 
 
272 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  31.1 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  30.91 
 
 
157 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  30.38 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  29.75 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  30.91 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  30.91 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  30.91 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  30.06 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  30.91 
 
 
157 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  30.38 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0311  hypothetical protein  27.65 
 
 
274 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.968362  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  28.39 
 
 
157 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  28.3 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>