120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0915 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  99.36 
 
 
311 aa  627  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  77.81 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  78.67 
 
 
299 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  55.18 
 
 
335 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  31.4 
 
 
268 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.87 
 
 
264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  31.27 
 
 
275 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  28.57 
 
 
508 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  27.84 
 
 
501 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  27.84 
 
 
507 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  27.94 
 
 
496 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.57 
 
 
381 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  28.31 
 
 
498 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  28.31 
 
 
498 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  30.7 
 
 
378 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
478 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.57 
 
 
480 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  27.94 
 
 
498 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  25.76 
 
 
412 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  26.19 
 
 
260 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.57 
 
 
564 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28.57 
 
 
483 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  28.57 
 
 
472 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  30.55 
 
 
253 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  28.57 
 
 
483 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28.57 
 
 
477 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  30.96 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  30.18 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  31.27 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  28.47 
 
 
249 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  26.76 
 
 
421 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  25.76 
 
 
440 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  34.07 
 
 
470 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  30.69 
 
 
600 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  27.45 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  28.15 
 
 
842 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  24.83 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  30.08 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  27.19 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  27.66 
 
 
787 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  25.9 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  23.89 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  23.89 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  32.95 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  26.09 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  24.29 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.86 
 
 
789 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  35.71 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  24.89 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  26.1 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  24.9 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  25.48 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  24.03 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  33.86 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  25.63 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  27.2 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  31.97 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  24.9 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.42 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  24.9 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  25.36 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  23.29 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  31.71 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  25.7 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  26.82 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  24.79 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  30.47 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  29.17 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.81 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.84 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  30.33 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  23.69 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  30.33 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  31.75 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  27.78 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  30.33 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  24.05 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  25.51 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  22.49 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  30.73 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  22.73 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  25.35 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  25.35 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  22.63 
 
 
432 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  26.97 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  26.06 
 
 
246 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  27.64 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  23.39 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  32.2 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  27.64 
 
 
629 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  31.36 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  27.31 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  23.97 
 
 
263 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  23.81 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>