199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0541 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  63.98 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  60.57 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  74.32 
 
 		 564 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  60.59 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  76.43 
 
 		 508 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  56.19 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  81.05 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  80.35 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  80.7 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  56.27 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  80.7 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  55.98 
 
 		 483 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  80.14 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  56.51 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  78.45 
 
 		 477 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  71.84 
 
 		 421 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  64.23 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  54.07 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  57.91 
 
 		 264 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  43.75 
 
 		 260 aa  219  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  38.1 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  38.32 
 
 		 253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  38.83 
 
 		 253 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  37.73 
 
 		 249 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  33.54 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  36.28 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  48.32 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  30.87 
 
 		 842 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  33.82 
 
 		 787 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  35.4 
 
 		 789 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  33.12 
 
 		 600 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.91 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  27.67 
 
 		 311 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  27.33 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  27.33 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  25.15 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  29.01 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  31.76 
 
 		 272 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  29.8 
 
 		 249 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  28.46 
 
 		 258 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  28.11 
 
 		 258 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  27.14 
 
 		 329 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  30.16 
 
 		 275 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  27.4 
 
 		 259 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  29.39 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  32.77 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  27.24 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  31.31 
 
 		 286 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  28.85 
 
 		 552 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  27.67 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  30.04 
 
 		 264 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  27.69 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.74 
 
 		 284 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  26.94 
 
 		 246 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 234 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  26.64 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 234 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  28.74 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  28.63 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  28.87 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  30.49 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  27.34 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  28 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  28 
 
 		 232 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  27.03 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  28 
 
 		 232 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  28.76 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  27.95 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  30.86 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  26.84 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  29.33 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  29.91 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  29.71 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.9 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  27.59 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  30.36 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  26.97 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  29.51 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  26.69 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  29.53 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  27.02 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  32.89 
 
 		 629 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  33.08 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  34.06 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  27.4 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  30.9 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.03 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  27.03 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  27.03 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  27.14 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  26.64 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  27.05 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  27.56 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  25.66 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>