77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0207 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  78.29 
 
 		 183 aa  290  8e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  54.61 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  56.85 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  56.85 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  54.79 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  58.96 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  45.19 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  43.65 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  39.71 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  38.93 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  45.93 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  31.01 
 
 		 842 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  31.01 
 
 		 787 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  29.11 
 
 		 600 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  24.24 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.05 
 
 		 789 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  29.51 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  27.52 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  27.46 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  25.97 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  40.58 
 
 		 487 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.8 
 
 		 268 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  26.24 
 
 		 371 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  26.09 
 
 		 279 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  27.87 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  29.06 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  25.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  25.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  25.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  28.23 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  35.82 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.11 
 
 		 501 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  35.82 
 
 		 496 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  24.79 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  35.82 
 
 		 498 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  35.82 
 
 		 498 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.11 
 
 		 507 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  34.33 
 
 		 440 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  37.31 
 
 		 508 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  24.32 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  35.82 
 
 		 564 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  24.49 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  35.82 
 
 		 498 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  35.82 
 
 		 472 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  23.57 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  34.85 
 
 		 421 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  27.87 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  25.98 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  34.33 
 
 		 381 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  27.33 
 
 		 412 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  34.92 
 
 		 478 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  23.38 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  22.22 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  22.22 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  29.92 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  34.92 
 
 		 480 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  24.39 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  23.38 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  23.38 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  38.46 
 
 		 432 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  35.62 
 
 		 287 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  31.82 
 
 		 275 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  24.63 
 
 		 448 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  29.69 
 
 		 439 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  27.78 
 
 		 285 aa  41.6  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  24.68 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>