29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1879 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
152 aa  297  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  70.63 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  69.8 
 
 
154 aa  185  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  72.93 
 
 
164 aa  184  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  63.58 
 
 
148 aa  184  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  38.93 
 
 
194 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  39.19 
 
 
183 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  37.41 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  38.52 
 
 
215 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  38.52 
 
 
215 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  38.81 
 
 
193 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  37.78 
 
 
193 aa  104  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  37.78 
 
 
215 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  27.16 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  29.66 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  24.65 
 
 
600 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  24.82 
 
 
216 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  24.11 
 
 
203 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  25.31 
 
 
228 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  24.11 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  24.11 
 
 
217 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  21.99 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 
260 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  24.82 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  25.31 
 
 
205 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  23.36 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  26.67 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  24.83 
 
 
275 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>