20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1242 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 164 aa  319  9.000000000000001e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  70.37 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  68.18 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  72.93 
 
 		 152 aa  175  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  69.7 
 
 		 154 aa  163  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  39.71 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  36.3 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  39.26 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  39.26 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  39.26 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  37.78 
 
 		 215 aa  97.4  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  36.3 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  35.81 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2275  protein of unknown function DUF88  32.47 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  26.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  27.16 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  24.46 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  26.04 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  26.04 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  26.04 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>