74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0543 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  98.45 
 
 		 215 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  98.45 
 
 		 215 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  87.63 
 
 		 215 aa  338  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  81.69 
 
 		 193 aa  256  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  53.16 
 
 		 183 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  58.96 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  58.91 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  41.27 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  39.26 
 
 		 164 aa  101  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  40.77 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  38.81 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  43.08 
 
 		 154 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.79 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  26.38 
 
 		 408 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  32.11 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  25 
 
 		 787 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  27.72 
 
 		 421 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  22.58 
 
 		 789 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.07 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  22.58 
 
 		 600 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  30.36 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  36.62 
 
 		 287 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  29.55 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  27.39 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  25.99 
 
 		 564 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28.35 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  34.85 
 
 		 487 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  32.38 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  28.15 
 
 		 507 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  25.47 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  22.98 
 
 		 335 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  28.35 
 
 		 478 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  25.68 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  25.68 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  30.48 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28 
 
 		 483 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  28 
 
 		 472 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  26.32 
 
 		 294 aa  45.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2825  hypothetical protein  25.25 
 
 		 244 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28 
 
 		 477 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.35 
 
 		 480 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  28 
 
 		 483 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 501 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  27.46 
 
 		 440 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 507 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  28.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  26.09 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.05 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  25.48 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.13 
 
 		 381 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  30.16 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  25.83 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  29.23 
 
 		 432 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  21.98 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.13 
 
 		 508 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  24.84 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  24.84 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  30.37 
 
 		 496 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4306  protein of unknown function DUF88  26.17 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4244  protein of unknown function DUF88  26.17 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.37 
 
 		 498 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  29.75 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 378 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  29.75 
 
 		 285 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4264  protein of unknown function DUF88  31.65 
 
 		 261 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 470 aa  41.2  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  30.37 
 
 		 498 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  30.37 
 
 		 498 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>